Haplogruppe A wird in indigenen Amerikanern, als auch in Asiaten gefunden. Mitglieder dieser Gruppe überquerten während der Eiszeit die Beringia Landbrücke nach Nordamerika.

Haplogruppe B ist eine der erstrangigen Ostasiatischen Ahnenlinien. Mitglieder der Haplogruppe B migrierten vor etwa 15 bis 20 Tausend Jahren ebenfalls nach Amerika und wurden zu einer der fünf mitochondriellen Ahnenlinien, die unter den indigenen Amerikanern identifiziert werden.

Haplogruppe C ist ein Nachkomme der Haplogruppe M, eine der zwei wesentlichen Ahnenlinien, die Afrika verließen um sich im Rest der Welt niederzulassen. Sie werden aktuell in Nordostasien gefunden und werden als die Gründerlinie der indigenen-amerikanischen Population angesehen.

Haplogruppe D ist die wesentliche ostasiatische Ahnenlinie. Beachtliche Untergruppen umfassen D4, welche hauptsächlich in Menschen aus Zentralasien gefunden wird, und D1, eine der fünf Haplogruppen, die in den indigenen Amerikanern zu finden sind.

Haplogruppe E kam wahrscheinlich in der Nähe von Nordost- Sundaland (Östliches Malaysia) auf und verbreitete sich auf der gesamten Insel von Südostasien, wo vor 5 bis 10 Tausend Jahren unterschiedliche Untergruppen florierten.

Haplogruppe F kam in Zentralasien auf und verbreitete sich schnell in Richtung Osten um eine der wesentlichen mitochondriellen Ahnenlinien in Ost- und Südostasien zu werden. Die größte Häufigkeit und Sequenzvielfalt kann unter den asiatischen Küstenbevölkerungen gefunden werden.

Haplogruppe H ist die am häufigsten zu findende Haplogruppe in Eurasien. Gefolgt vom Letzteiszeitlichen Maximum vor etwa 20.000 Jahren, dominierten die Menschen der Haplogruppe H die Bevölkerungsausweitung in Europa. Das Ergebnis ist die einheitliche Distribution dieser Gruppe in ganz Europa.

Haplogruppe HV ist die frühere Haplogruppe zu H und V, welche heutzutage die Ahnenlinie in Westeuropa dominiert. Etwa 75% der westeuropäischen Population stammt von dieser Haplogruppe ab.

Haplogruppe I ist in Europa weit verbreitet, wenn auch in recht niedrigen Niveaus (etwa 2%). Sie wird auch im westlichen Eurasien gefunden und es wird angenommen, dass die frühen Mitglieder der Haplogruppe I durch den Kaukasus zogen um ihre Ahnenlinie während der alten Steinzeit nach Europa zu tragen.

Haplogruppe J ist eine der vier wichtigsten Haplogruppen, die spezifisch für Europa sind. Es wird geglaubt, dass die Ausbreitung der Haplogruppe J nach Europa während der neolithischen Zeit (neuen Steinzeit) durch die ersten Bauern- und Herdengemeinschaften von Westasien verursacht wurde.

Haplogruppe K stammt aus Westasien und verteilte sich durch Europa. Bestimmte Ahnenlinien werden auch in Zentralasien und Nordafrika gefunden. Sie ist bekannt für die Präsenz in bestimmten Populationsgruppen, wie den prähistorischen Basken und den aschkenasischen Juden.

Haplogruppe L0 ist die älteste Haplogruppe auf dem menschlichen mtDNA Baum. L0 kam vor etwa 150.000 Jahren in Ostafrika auf, wo die ältesten Fossilien von anatomisch modernen Menschen gefunden wurden. L0a kam 100.000 Jahre später auf und wurde in den südöstlichen Teil des Kontinents getragen.

Haplogruppe L1 ist einer der ältesten Zweige des mütterlichen Familienbaums, eine Tochter der mitochondriellen Eva und eine Schwester zu L0. Sie wird am häufigsten im westlichen und zentralen Teil von Subsahara-Afrika gefunden und erscheint nur selten im östlichen oder südlichen Afrika. L1 erschuf Zweige wie L2–L6, während L3 alle heutzutage vorkommenden non-afrikanischen Haplogruppen erschuf.

Haplogruppe L2 ist ein direkter Nachkomme der mitochondriellen Eva. Sie wird aktuell in 1/3 der Subsahara-Afrikaner gefunden und ist eine Untergruppe von L2a, die häufigste mtDNA Haplogruppe unter Afroamerikanern.

Haplogruppe L3, eine Tochter der mitochondriellen Eva, war eine der ersten Gruppen an Menschen, die Afrika verließen um den Rest der Welt zu besiedeln. Asiatische und europäische Haplogruppen basieren auf L3.

Haplogruppe M Mitglieder waren unter den ersten Menschen die Afrika verließen und nach Osten entlang der südlichen Küste von Asian migrierten. Die Untergruppe M1 fasziniert Wissenschaftler mit der Präsenz in Ostafrika; eine weitere Untergruppe, M3, soll angeblich aus Indien stammen.

Haplogruppe N ist eine der beiden wichtigsten Ahnenlinien, von denen non-afrikanische Haplogruppen abstammen. Die Mitglieder dieser Gruppe werden heute auf vielen Kontinenten weltweit gefunden.

Haplogruppe R ist sehr alt und komplex; die Mitglieder können heute auf der ganzen Welt gefunden werden. Der Ursprung liegt im Nahen Osten, während sich die Haplogruppe R nach Afrika, Südwest-Eurasien, Mittleren Osten und nach Zentral- und Südamerika ausbereitete.

Haplogruppe T ist eine relativ junge Haplogruppe und wird als eine der Gründerlinien der neolithischen Periode angesehen, als die Menschen lebten.

Haplogruppe U ist eine der ältesten und vielseitigsten Haplogruppen Europas: sie reicht zurück in die Expansion der Landwirtschaft in Europa. Etwa 10-11% aller Europäer und europäischen Amerikaner gehören dieser Haplogruppe an.

Haplogruppe V ist eine europäische Haplogruppe, die am Ende der Eiszeit in Iberien (Spanien) aufkam und sich während der Neubevölkerung in Richtung Norden und Süden Europas verbreitete.

Haplogruppe W wird noch immer häufig an seinem Ursprungsort gefunden, auch wenn sie in ganz Eurasien aufgefunden werden kann. Sie wird mit der Erscheinung der Aurignacien Kultur während dem Jungpaläolithikum in Verbindung gebracht.

Haplogruppe X kam in Südwestasien auf und verbreitete sich von hier nach Europa, Nordafrika und in den Nahen Osten. Seine Untergruppe X2 ist eine der grundlegenden Ahnenlinien in indigenen Amerikanern.

Haplogruppe Y steht in Verbindung mit der sibirischen Population und wird auch in japanischen, koreanischen und manchen südostasiatischen Populationen gefunden.

Haplogruppe Z wird in ganz Asien gefunden, mit höheren Konzentrationen in Tibet und Sibirien und geringeren Konzentrationen in Japan. Eine Untergruppe, Z1, wird auch unter dem finnischen Volk Samen gefunden, welche sowohl europäische, als auch asiatische Vorfahren haben sollen.